Secret Mission vous met dans la peau d'un soldat ou d'une femme soldat. Les ennemis arrivent par groupes et vous devez tous les repousser. Rien de plus simple si vous êtes armé correctement, n'est-ce pas ? Alors prenez votre fusil d'assaut et repoussez-les. Votre mission ? Récupérer des documents secrets, volés par l'ennemi.
Vous choisissez d'abord votre personnage (homme ou femme). Vous le contrôlez avec les touches directionnelles, pour vous déplacer de gauche à droite et de haut en bas et vice-versa. Appuyez sur S pour tirer, R pour recharger l'arme et A pour utiliser le couteau. Le but est d'arriver à la fin du niveau et de tuer tous les ennemis sur votre passage. Passez sur les armes qui se trouvent au sol pour vous en équiper. Tirez sans modération : les munitions sont illimitées.